قامت الشركة باتخاذ العديد من الإجراءات وبخطة مدروسة لتخفيض نسبة الفاقد من المياه على الصعيدين الفني والإداري بهدف الوصول إلى نسبة تنافس محلياً وعالمياً، الأمر الذي أدى إلى تخفيض نسبة الفاقد على نطاق محافظة العقبة من 37.22% عام 2004 إلى 23.57%  نهاية عام 2008، أما على نطاق مدينة العقبة فقد تم تخفيض نسبة الفاقد من 32.12% عام 2004 إلى 21.02%  نهاية عام 2008، وهي النسبة الأفضل على مستوى المملكة.
لقد استحدثت الشركة وحدة متخصصة لمتابعة الفاقد و قامت بتدريب الكوادر على أحدث ما توصلت إليه التقنيات الحديثة في هذا المجال بهدف تخفيض نسبة الفاقد إلى حدود 15% نهاية عام 2010.